Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
DMDP11532 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DMDP11532 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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