Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms