Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSF2P04141 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSF2P04141 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms