Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VTNP04004 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VTNP04004 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VTNP04004 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms