Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1RP00736 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1RP00736 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1RP00736 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms