Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms