Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF208O43345 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF208O43345 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF208O43345 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF208O43345 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF208O43345 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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