Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms