Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRD1A4D1F6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms