Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms