Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms