Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD54BQ9Y620 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms