Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms