Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF18Q9Y5U5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms