Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCYT1BQ9Y5K3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCYT1BQ9Y5K3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms