Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FARP1Q9Y4F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FARP1Q9Y4F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms