Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HCC1Q9Y3T6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms