Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX2Q9Y2T7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX2Q9Y2T7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX2Q9Y2T7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms