Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB41L3Q9Y2J2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPB41L3Q9Y2J2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms