Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKBQ9Y259 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKBQ9Y259 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms