Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms