Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOD1Q9Y239 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms