Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
TRAK1Q9UPV9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAK1Q9UPV9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms