Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM35Q9UPQ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM35Q9UPQ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM35Q9UPQ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms