Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF112Q9ULX5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF112Q9ULX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms