Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABT1Q9ULW3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABT1Q9ULW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABT1Q9ULW3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms