Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FZD4Q9ULV1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FZD4Q9ULV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms