Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRFN2Q9ULH4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN2Q9ULH4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms