Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN1Q9ULB1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN1Q9ULB1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms