Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN16Q9UKR8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN16Q9UKR8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms