Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJD2Q9UKL4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms