Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMEB2Q9UKD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GMEB2Q9UKD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GMEB2Q9UKD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms