Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGA1Q9UJY5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms