Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TSKSQ9UJT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSKSQ9UJT2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms