Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNNA3Q9UI47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNA3Q9UI47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms