Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX20Q9UHI6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX20Q9UHI6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms