Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGXB4Q9UGU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms