Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF20Q9UGU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCF20Q9UGU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms