Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DKK4Q9UBT3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms