Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL9Q9P2J3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL9Q9P2J3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms