Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRNQ9P2B2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms