Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNRD1Q9P1U0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNRD1Q9P1U0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms