Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXXC1Q9P0U4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms