Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD2L2Q9NZM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms