Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NOP53Q9NZM5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOP53Q9NZM5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP53Q9NZM5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP53Q9NZM5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP53Q9NZM5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP53Q9NZM5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP53Q9NZM5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOP53Q9NZM5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms