Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBP1Q9NZI7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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