Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGA3Q9NZ52 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms