Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MIS18AQ9NYP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MIS18AQ9NYP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
MIS18AQ9NYP9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIS18AQ9NYP9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms