Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D2Q9NY47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms