Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH4Q9NXW9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms